馬駒橋是經歷了由地名到橋名、又由橋名到地名漫長的歷史階段。
公元618年前后即隋末唐初時，大運河北段即水濟渠流經涼水河中段，那時，馬駒橋地區是豐盛的草場，當朝在此放養大量的軍馬。為了便于管理，對公馬、種馬、仔馬（馬駒）分養分牧。馬駒橋地區是仔馬馬場，管理仔馬的軍民建立了村落取名“馬駒里”，“馬駒里”緊挨涼水河南岸。當時河上搭設了一座簡易的木橋（浮橋）賴以南北通行，此橋因“馬駒里”而得名“馬駒橋”。
星移斗轉，到了明朝英宗年間，“馬駒里”已發展成商賈云集的小鎮，又加上與地處皇家獵場（海子）的出口棗東紅門隔河相望，明英宗朱祁鎮狩獵之余，出東紅門過馬駒橋到馬駒里逛街看景，十分消遣。
一年夏季，明英宗狩獵后又出東紅門想去馬駒里看看。突然間，烏云密布，雷電交加，大雨如注。隨行人報：“涼水河水猛漲，沖垮了馬駒橋。英宗十分掃興，轉念又想，馬駒里如此繁盛，應該修一座像樣提橋，方便百姓更方便自己。于是，他對隨行的大臣們說：“馬駒里修橋，國庫無幣銀可撥，我帶頭掏腰包，算作辦點善事吧。”皇帝出資，大臣們哪個敢怠慢，爭相解囊。當時的著名皇家土木巨匠蒯祥愿義務設計。由于是皇帝帶頭集資，加之蒯祥的設計，一座九孔石拱橋于天順八年，即公元1465年建成。英宗親賜“宏仁”橋。可老百姓仍習慣稱之“馬駒橋”，一些鄉紳土豪也模棱兩可地叫它“宏仁馬駒橋”，橋出了名，馬駒里也隨之改叫馬駒橋鎮。
公元1774年，即清乾隆38年，重修馬駒橋，改九孔為七孔，橋南側修橋亭兩座，內立乾隆親書御碑修橋記。現殘碑移至通州西海子公園葫蘆湖邊。1964年，馬駒橋拆毀建水泥大橋，碑亭毀于“文革”。
馬駒橋鎮地處北京東南郊，通州衛星城的西南，緊鄰北京經濟技術開發區，是北京市政府確定的郊區重點建設的33個中心鎮之一，是北京市總體規劃的城鎮體系布局中亦莊衛星城的組成部分。全鎮行政區域面積88平方公里，轄50個行政村，4萬口人。

始建于明朝順七年的馬駒橋，是一個歷史悠久的京畿古鎮。2001年2月15日經市政府批準為市級中心鎮以來，通過充分發揮得天獨厚的區位交通優勢，制定戰略規劃，明確發展思路，馬駒橋經濟和社會各項事業則進入了一個快速發展的歷史階段。兩個市級開發區--北京國家環保產業園區、北京通州物流產業園區在鎮內全面啟動，更是賦予了馬駒橋無限的發展潛力。未來的馬駒橋將不是一般意義上的農村小城鎮，而是首都現代化國際大都市的近郊和衛星城的組成部分，承擔著市區和衛星城延伸的部分城市功能，成為帶動農村發展、加快農村城市化進程的一個典型窗口。
在規劃中的亦莊新城地區，更值得多說幾句的是其南部的馬駒橋。馬駒橋是北京東南郊的一個大鎮，西北距北京舊城40里。這里有一條大河，今名涼水河，實為魏晉北朝時期和元明時期的永定河故道。河上原有渡口。歷史上“凡外郡畿內之人自南而來者，東西二途胥出此渡。車之大而駕者，小而挽者，物類之馱者，人之有肩負者、騎者、步者，紛紛絡繹，四時不休。”由此可見，經過這里而進出北京的路上是十分繁忙的。為了方便行旅，當地有錢有勢的人便在河上架起木橋，稱馬駒橋。為什么叫馬駒橋，文獻未載，難以說清。但是簡易的木橋往往被夏秋的大水沖垮，所以每年冬春都要架一次木橋，費時費力。為了一勞永逸，明天順七年（1463年）動用國庫銀兩在這里修建了一座長25丈、寬3丈、下有九孔、上有雕欄的大型石橋，英宗皇帝賜名“宏仁橋”，顯示這是一項宏大的仁政工程。同時在橋東頭建了一座碧霞元君廟。每年的陰歷四月初八日是元君誕辰，屆時京城士女競相前往進香。進香的人皆頭頂一尊元君像，背負著楮錠即紙錢，有的走一步即拜一次，一路上步步叩拜，走三天才能到廟上。有的走五步一拜，或十步二十步一拜，走一天即到了。沿途旗幡飄揚，鑼鼓聲噪，十分熱鬧，足見這座碧霞元君廟的香火之盛。明清時期北京城四郊有五座碧霞元君廟，俗稱“五頂”，即東直門外東頂，德勝門外北頂，藍靛廠西頂，大紅門外南頂，草橋中頂。也有說南頂就是宏仁橋頭的碧霞元君廟。為什么碧霞元君廟在北京稱“頂”呢？這大概與北京進香的人頭上都頂著一尊碧霞元君像有關系，或者是碧霞元君在北京被尊為“泰山頂上天仙圣母”的緣故。清乾隆年間，對宏仁橋和碧霞元君廟又重新修葺，橋改稱馬駒橋。正是因為馬駒橋是進出北京的大道之一，又有香火極盛的碧霞元君廟，所以在這里形成一個大型村落，這就是馬駒橋鎮，今屬通州區。
原先馬駒橋是作為亦莊第二生活區提出規劃，后來大興和開發區合并，發展方向轉向西南，開始發展大興區域，由此馬駒橋就邊緣化了。
如果將眼光放得稍遠些，我們則可看到亦莊不僅擁有明清皇家苑囿南苑的地利，而且這里背依京城、朝陽區，面向青云店、安定，東瞻通州，西望大興。這些地名都令人浮想聯翩，心懷憧憬。“京”者，高岡也，大也；“朝陽”者，有無限生命力也；“青云店”，青云直上也；“安定”，安穩無虞也；“通州”，通順暢達也；“大興”，興旺發達也。這些地名都含蘊吉利之義，寄托人們的美好意愿。